本愿寺八代法主莲如上人革新教务，随后数代法主完善了坊官制度。一向宗的组织力比起一般宗派厉害许多，但也留下了不少隐患。
石山本愿寺与地方寺院一直有矛盾存在。坊官制度是由石山派遣坊官去地方，对各地一向一揆拥有指挥权。
但一向宗基层的组织，讲，却是控制在地方寺院手中。一寺至少一讲，大寺有四五讲，这些讲在寺院中集会，由主持与坊主掌控。
一向宗底层的三股势力，其一尼兵团，其二一揆众，其三信众。
尼兵团是寺院养着看家护院的武装力量，一揆众是地侍，野武士等武家投效过来，多半心有所图。
虔诚信众是由讲组织起来的村落愚民，她们战力低微，但村落却是一向宗的经济基础，非常重要。
本山的法主通过派遣坊官，制约地方上的坊主尼官，形成了一套行之有效的管理体系。
但本山与地方的利益，有时候未必一致，这就导致了许多矛盾。
利益越大，矛盾越大。
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